光吸收酶标仪：在特定波长下，检测被测物吸光值。光通过被检测物，前后的能量差异即是被检测物吸收掉的能量，特定波长下，同一种被检测物的浓度与被吸收的能量成定量关系。光吸收的检测技术成熟，成本低，操作简单，但是动态范围窄，灵敏度比较低，特异性不强，一般可见光和紫外光分别采用钨灯及氘灯作为光源，而紫外/可见酶标仪是可以将两种光源进行切换，适应不同测量波长的需求。
化学发光酶标仪：是来自生物化学反应中的自发光，可分为辉光型和闪光型两种类型，辉光型发光持久，稳定，能持续一段时间；闪光型发光时间短,变化快，稳定性不强，需要应用自动加样器才可以进行，化学发光中发出的光子数与样品量呈一定比例关系，化学发光酶标仪灵敏度非常高,动力学范围广。
多功能酶标仪：是以上三种酶标仪的集合，它集成了两种或者三种酶标仪于一体，拥有多种检测模式的单体台式酶标仪，可检测吸光度(Abs)、荧光强度(FI)、时间分辨荧光(TRF)、荧光偏振(FP)、和化学发光(Lum)。
目前，酶标仪广泛地应用在临床检验、生物学研究、农业科学、食品和环境科学中，特别在近几年中，由于大量的酶联免疫试剂盒的应用，使得酶标仪在生殖保健领域中应用越来越广泛，同时促进了生殖健康技术水平提高。